MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 5139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017450	GCTT	2	8	23	30	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017450	TTAT	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017450	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017450	T	6	6	136	141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017450	A	8	8	168	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017450	A	9	9	177	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017450	TAA	2	6	2762	2767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017450	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017450	T	6	6	4071	4076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017450	T	6	6	4100	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017450	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017450	T	6	6	4128	4133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017450	A	6	6	4134	4139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017450	TA	3	6	4154	4159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017450	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017450	ATT	2	6	4183	4188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017450	ATA	2	6	4205	4210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017450	ATT	2	6	6268	6273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017450	AT	3	6	6274	6279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017450	A	6	6	6291	6296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017450	AAAT	2	8	6302	6309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017450	AAT	2	6	6713	6718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017450	A	7	7	7639	7645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017450	GTT	2	6	7646	7651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017450	TA	3	6	7653	7658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017450	A	6	6	7670	7675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017450	TTTAG	2	10	7700	7709	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017450	TAA	2	6	7933	7938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017450	T	6	6	7956	7961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017450	ATT	2	6	7962	7967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017450	TTTA	2	8	7974	7981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017450	T	6	6	7991	7996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017450	GTA	2	6	8029	8034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017450	T	6	6	8094	8099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017450	ATA	2	6	8110	8115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017450	ATA	2	6	8138	8143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017450	ATT	3	9	8155	8163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017450	T	6	6	8169	8174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017450	GGC	2	6	8181	8186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017450	TTTA	2	8	8214	8221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017450	AAT	2	6	8276	8281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017450	TAT	2	6	8314	8319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017450	TAA	2	6	8768	8773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017450	ATA	2	6	8786	8791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017450	T	6	6	8841	8846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017450	CAAC	2	8	8860	8867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017450	AT	3	6	8898	8903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017450	AC	3	6	8931	8936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017450	TAT	2	6	8959	8964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017450	TAG	2	6	8990	8995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017450	TTA	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017450	CTT	2	6	9191	9196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017450	CTA	2	6	9200	9205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017450	TTA	2	6	9248	9253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017450	T	6	6	9300	9305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017450	ATA	2	6	9354	9359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017450	GTT	2	6	12116	12121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017450	T	8	8	12120	12127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017450	T	6	6	12139	12144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017450	CATTT	2	10	12151	12160	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017450	TTAT	2	8	12171	12178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017450	TCT	2	6	12205	12210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017450	AAAT	2	8	12220	12227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017450	T	6	6	12243	12248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017450	A	6	6	12982	12987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017450	TTTAG	2	10	13012	13021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017450	TAA	2	6	13245	13250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017450	T	6	6	13268	13273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017450	ATT	2	6	13274	13279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017450	TTTA	2	8	13286	13293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017450	T	6	6	13303	13308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017450	GTA	2	6	13341	13346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017450	TAA	3	9	13408	13416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017450	TTA	2	6	13427	13432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017450	ATA	2	6	13438	13443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017450	ATT	3	9	13455	13463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017450	T	6	6	13469	13474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017450	GGC	2	6	13481	13486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017450	TAGCT	2	10	13556	13565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017450	AAGA	2	8	13682	13689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017450	TTA	2	6	13714	13719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017450	CAG	2	6	13744	13749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017450	T	6	6	13784	13789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017450	TTA	2	6	13798	13803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017450	TTA	2	6	13819	13824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017450	TTA	2	6	13919	13924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017450	A	7	7	15193	15199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017450	TA	3	6	15205	15210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017450	TAAT	2	8	15250	15257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017450	AGA	2	6	15274	15279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017450	A	6	6	15287	15292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017450	TTAA	2	8	15313	15320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017450	A	7	7	15404	15410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017450	TGA	2	6	15444	15449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017450	A	6	6	15472	15477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017450	AT	3	6	15499	15504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017450	TTTA	2	8	16537	16544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017450	TA	3	6	16550	16555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017450	T	6	6	16624	16629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017450	GACTTT	2	12	16691	16702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017450	AT	3	6	16705	16710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017450	T	7	7	16751	16757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017450	TCAG	2	8	16772	16779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017450	CTA	2	6	16804	16809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017450	A	6	6	16851	16856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017450	AG	3	6	16901	16906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017450	AATT	2	8	18791	18798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017450	GAT	2	6	19632	19637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017450	CATT	2	8	19650	19657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017450	TAA	2	6	19669	19674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017450	TTGTT	2	10	19684	19693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017450	GTTT	2	8	19695	19702	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017450	AAT	2	6	20275	20280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017450	AAC	2	6	24745	24750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017450	TGA	2	6	24758	24763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017450	GAA	2	6	24773	24778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017450	A	6	6	24777	24782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017450	T	6	6	24797	24802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017450	T	6	6	24811	24816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017450	T	7	7	24877	24883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017450	T	6	6	24959	24964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017450	AT	3	6	24999	25004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017450	T	6	6	25020	25025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017450	T	7	7	25028	25034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017450	TATAT	2	10	25065	25074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017450	AGT	2	6	25113	25118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017450	TGT	2	6	25128	25133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017450	TGA	2	6	26192	26197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017450	GAT	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017450	TA	4	8	26392	26399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017450	T	6	6	26432	26437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017450	AT	3	6	26447	26452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017450	ATTA	2	8	26457	26464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017450	A	7	7	26490	26496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017450	ATT	2	6	26513	26518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017450	T	8	8	26520	26527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017450	TAT	2	6	27637	27642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017450	TTGT	2	8	28345	28352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017450	TTA	2	6	28362	28367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017450	ACTA	2	8	28368	28375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017450	AGG	2	6	28464	28469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017450	AAT	2	6	30897	30902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017450	CTGTA	2	10	30918	30927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017450	ATTT	2	8	30987	30994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017450	TC	3	6	31000	31005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017450	ATTG	2	8	31016	31023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017450	AAT	2	6	31118	31123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017450	TATT	2	8	31386	31393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017450	ACT	2	6	31749	31754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017450	AT	3	6	31831	31836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017450	GCTT	2	8	31934	31941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017450	ATAAGT	2	12	32019	32030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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